心靈部隊(duì)和克拉克總統(tǒng)的政府發(fā)現(xiàn)了埋藏在地球太陽(yáng)系中的暗影飛船，并開(kāi)始利用這些飛船的先進(jìn)技術(shù)。克拉克政府的排外主義和極權(quán)主義日益盛行，并以軍事事件為借口宣布戒嚴(yán)。這引發(fā)了火星的獨(dú)立戰(zhàn)爭(zhēng)，而火星長(zhǎng)期以來(lái)與地球的政治關(guān)系一直緊張。巴比倫5號(hào)也宣布脫離地球獨(dú)立，其他幾個(gè)地球聯(lián)盟的外圍殖民地也宣布獨(dú)立。作為回應(yīng)，地球聯(lián)盟試圖用武力奪回巴比倫5號(hào)，但在與空間站結(jié)盟對(duì)抗日益增長(zhǎng)的暗影威脅的明巴利人的幫助下，這次進(jìn)攻被擊退。